a été fondée en date du 2 septembre 1964 sous la forme d'une association, avec à sa tête un Conseil de direction. En date du 10 mai 1984, le Parlement de la République et Canton du Jura vote la loi sur l'enseignement privé et de ce fait, l'EJCM est reconnue d'utilité publique.

Ces événements débouchent sur la modification du statut de l'école par la constitution de la fondation EJCM, dirigée par un Conseil de fondation composé de 13 membres qui représentent l'Etat, les principales communes jurassiennes ainsi que Moutier, le président de l'association des Amis de l'EJCM, un représentant des professeurs et la direction.